1970 wurde Mohrkirch, im Zuge der räumlichen Neuordnung der Gemeinden und Ämter zur Vereinfachung der Gemeindeverwaltung und der wirtschaftlichen Stärkung, aus den bis dahin selbständigen Gemeinden Mohrkirch-Westerholz und Mohrkirch-Osterholz gegründet. Erst durch die Erschließung eines Neubaugebietes zwischen den beiden Ortsteilen hat sich ein Ortskern entwickelt. Mohrkirch ist aber auch heute noch sehr weitläufig. Viele Häuser und Höfe liegen verstreut in dem 14.4 qkm großem Gemeindegebiet. Es wird überwiegend landwirtschaftlich genutzt.

Der Ortsname lässt sich auf das ehemalige Kloster und spätere Domanialgut Mohrkirchen (1778) ableiten.

Die Gemeinde hat eine zentrale Lage in Angeln, so liegen die nächstgelegenen Städte Flensburg,